Rella, Simón A
Rates of SARS-COV-2 transmission and vaccination impact the fate of vaccine-resistant strains electrónico / Simón A. Rella, Yuliya A. Kulikova, Emmanouil T. Dermitzakis and Fyodor A. Kondrashov .-- Madrid : Banco de España , 2021
.--36 p .-- ( Banco de España. Documentos de trabajo ; ,2129 ).
Disponible en formato PDF en el repositorio de la Biblioteca del IEF con el nombre : OL 1828
Vaccines are thought to be the best available solution for controlling the ongoing SARSCoV-2 pandemic. However, the emergence of vaccine-resistant strains may come
too rapidly for current vaccine developments to alleviate the health, economic and
social consequences of the pandemic. To quantify and characterize the risk of such
a scenario, we created a SIR-derived model with initial stochastic dynamics of the
vaccine-resistant strain to study the probability of its emergence and establishment.
Using parameters realistically resembling SARS-CoV-2 transmission, we model a wavelike pattern of the pandemic and consider the impact of the rate of vaccination and the
strength of non-pharmaceutical intervention measures on the probability of emergence
of a resistant strain. As expected, we found that a fast rate of vaccination decreases
the probability of emergence of a resistant strain. Counterintuitively, when a relaxation
of non-pharmaceutical interventions happened at a time when most individuals of the
population have already been vaccinated the probability of emergence of a resistant strain
was greatly increased. Consequently, we show that a period of transmission reduction
close to the end of the vaccination campaign can substantially reduce the probability
of resistant strain establishment. These results, therefore, suggest the convenience of
maintaining non-pharmaceutical interventions and prevention protocols throughout the
entire vaccination period. Se considera que las vacunas son la mejor solución para controlar la actual pandemia
por SARS-CoV-2. Sin embargo, la proliferación de cepas resistentes a las vacunas puede
ser demasiado rápida para que su aplicación alivie la propagación de la pandemia,
así como sus consecuencias económicas y sociales. Para cuantificar y caracterizar el
riesgo de este escenario, utilizamos un modelo SIR con una dinámica estocástica para
estudiar la probabilidad de aparición y transmisión de cepas resistentes a la vacuna.
Usando parámetros que repliquen de manera realista la transmisión del SARS-CoV-2,
modelizamos el patrón en forma de olas de la pandemia y consideramos el impacto que el
ritmo de vacunación y la intensidad de las medidas de contención adoptadas tienen sobre
la probabilidad de aparición de cepas resistentes a la vacuna. Como era de esperar, un
ritmo rápido de vacunación disminuye la probabilidad de aparición de una cepa resistente
a la vacuna. Sin embargo, aunque en principio pueda parecer contraintuitivo, cuando
se produce una relajación de las restricciones en el momento en el que la mayoría de
la población ya ha sido vacunada, la probabilidad de aparición de una cepa resistente
a la vacuna aumenta considerablemente. En consecuencia, un período de contención
estricta de la transmisión cerca del final de la campaña de vacunación puede reducir
sustancialmente la probabilidad del establecimiento de cepas resistentes a la vacuna.
Estos resultados, por tanto, sugieren la conveniencia de mantener las medidas y los
protocolos de prevención durante toda la duración de la campaña de vacunación.
CORONAVIRUS
Kulikova, Yuliya A.
T. Dermitzakis, Emmanouil
A. Kondrashov, Fyodor
Rates of SARS-COV-2 transmission and vaccination impact the fate of vaccine-resistant strains electrónico / Simón A. Rella, Yuliya A. Kulikova, Emmanouil T. Dermitzakis and Fyodor A. Kondrashov .-- Madrid : Banco de España , 2021
.--36 p .-- ( Banco de España. Documentos de trabajo ; ,2129 ).
Disponible en formato PDF en el repositorio de la Biblioteca del IEF con el nombre : OL 1828
Vaccines are thought to be the best available solution for controlling the ongoing SARSCoV-2 pandemic. However, the emergence of vaccine-resistant strains may come
too rapidly for current vaccine developments to alleviate the health, economic and
social consequences of the pandemic. To quantify and characterize the risk of such
a scenario, we created a SIR-derived model with initial stochastic dynamics of the
vaccine-resistant strain to study the probability of its emergence and establishment.
Using parameters realistically resembling SARS-CoV-2 transmission, we model a wavelike pattern of the pandemic and consider the impact of the rate of vaccination and the
strength of non-pharmaceutical intervention measures on the probability of emergence
of a resistant strain. As expected, we found that a fast rate of vaccination decreases
the probability of emergence of a resistant strain. Counterintuitively, when a relaxation
of non-pharmaceutical interventions happened at a time when most individuals of the
population have already been vaccinated the probability of emergence of a resistant strain
was greatly increased. Consequently, we show that a period of transmission reduction
close to the end of the vaccination campaign can substantially reduce the probability
of resistant strain establishment. These results, therefore, suggest the convenience of
maintaining non-pharmaceutical interventions and prevention protocols throughout the
entire vaccination period. Se considera que las vacunas son la mejor solución para controlar la actual pandemia
por SARS-CoV-2. Sin embargo, la proliferación de cepas resistentes a las vacunas puede
ser demasiado rápida para que su aplicación alivie la propagación de la pandemia,
así como sus consecuencias económicas y sociales. Para cuantificar y caracterizar el
riesgo de este escenario, utilizamos un modelo SIR con una dinámica estocástica para
estudiar la probabilidad de aparición y transmisión de cepas resistentes a la vacuna.
Usando parámetros que repliquen de manera realista la transmisión del SARS-CoV-2,
modelizamos el patrón en forma de olas de la pandemia y consideramos el impacto que el
ritmo de vacunación y la intensidad de las medidas de contención adoptadas tienen sobre
la probabilidad de aparición de cepas resistentes a la vacuna. Como era de esperar, un
ritmo rápido de vacunación disminuye la probabilidad de aparición de una cepa resistente
a la vacuna. Sin embargo, aunque en principio pueda parecer contraintuitivo, cuando
se produce una relajación de las restricciones en el momento en el que la mayoría de
la población ya ha sido vacunada, la probabilidad de aparición de una cepa resistente
a la vacuna aumenta considerablemente. En consecuencia, un período de contención
estricta de la transmisión cerca del final de la campaña de vacunación puede reducir
sustancialmente la probabilidad del establecimiento de cepas resistentes a la vacuna.
Estos resultados, por tanto, sugieren la conveniencia de mantener las medidas y los
protocolos de prevención durante toda la duración de la campaña de vacunación.
CORONAVIRUS
Kulikova, Yuliya A.
T. Dermitzakis, Emmanouil
A. Kondrashov, Fyodor